El Laboratorio de Obito se encuentra en la Montaña Cementerio sólo fue visto cuando se teletransportó a sí mismo y a Danzō, en un intento por despegar los ojos de Shisui y cuando le trasplantó los ojos de Itachi a Sasuke. Hay muchos contenedores de vidrio, cada uno con los ojos Sharingan (Probablemente de los miembros del clan Uchiha que fueron asesinados por Itachi y Obito). La finalidad del laboratorio es desconocida.